Prof. Dr. Zakiyuddin, M.Ag. merupakan Rektor Universitas Islam Negeri (UIN) Salatiga dengan pangkat Pembina Utama (IV/e). Beliau menjabat sebagai Rektor UIN Salatiga sejak tahun 2022 setelah sebelumnya menjabat sebagai Rektor IAIN Salatiga pada periode 2019–2022, sekaligus memimpin proses transformasi kelembagaan dari IAIN menjadi UIN. Sebelumnya, beliau pernah mengemban amanah sebagai Direktur Program Pascasarjana IAIN Salatiga (2014–2019) dan Asisten Direktur Program Pascasarjana (2011–2014). Beliau menyelesaikan pendidikan Sarjana (S1) Perbandingan Agama di Universitas Muhammadiyah Surakarta, Magister (S2) Agama dan Filsafat, serta Doktor (S3) Studi Islam di IAIN Sunan Kalijaga Yogyakarta. Pada tahun 2017, beliau dikukuhkan sebagai Guru Besar Bidang Ilmu Studi Islam.
Sebagai akademisi, Prof. Zakiyuddin memiliki kepakaran di bidang Studi Islam, moderasi beragama, dan pluralisme serta aktif menghasilkan publikasi ilmiah di tingkat nasional maupun internasional. Di bawah kepemimpinannya, UIN Salatiga terus memperkuat tata kelola perguruan tinggi, meningkatkan kualitas pendidikan, penelitian, pengabdian kepada masyarakat, serta memperluas jejaring internasional. Atas kontribusinya di bidang akademik dan kepemimpinan, beliau tercatat dalam Top 35 Peneliti Indonesia Bidang Theology menurut AD Scientific Index 2024, menerima DPRD Award Kota Salatiga Tahun 2024, serta kembali dipercaya menjabat sebagai Rektor UIN Salatiga untuk periode 2024–2028.